Olink™

Oprogramowanie

Olink Insight – platforma do analizy i interpretacji danych proteomicznych

Olink Insight to bezpłatna, internetowa platforma bioinformatyczna wspierająca analizę, interpretację oraz wizualizację danych proteomicznych. Platforma umożliwia kompleksową pracę z danymi – od planowania eksperymentów, poprzez analizę statystyczną, aż po interpretację biologiczną uzyskanych wyników. Użytkownicy mogą importować własne zestawy danych, przeprowadzać analizy statystyczne (m.in. testy t-Studenta, ANOVA, analizę PCA), generować mapy cieplne oraz wizualizacje rozkładu próbek. Narzędzia dostępne w aplikacji pozwalają również na automatyczne wzbogacanie wyników o informacje dotyczące funkcji białek, szlaków biologicznych, procesów komórkowych, specyficzności tkankowej, powiązań z chorobami oraz potencjalnych celów terapeutycznych. Olink Insight integruje dane z renomowanych baz biologicznych oraz dużych projektów populacyjnych, takich jak UK Biobank Pharma Proteomics Project, umożliwiając porównanie wyników z danymi referencyjnymi obejmującymi dziesiątki tysięcy próbek.

Olink Analyze – pakiet do analizy danych proteomicznych

Olink Analyze to specjalistyczny pakiet oprogramowania, przeznaczony do analizy danych proteomicznych. Pakiet zawiera funkcje umożliwiające import danych, ich porządkowanie, kontrolę jakości (Quality Control, QC), wykrywanie wartości skrajnych oraz przygotowanie danych do dalszych analiz statystycznych. Olink Analyze oferuje szeroki zestaw metod analizy statystycznej. Pakiet został zintegrowany z popularnymi bibliotekami do analizy danych i wizualizacji. Dzięki kompleksowemu zestawowi funkcji obejmujących import danych, kontrolę jakości, analizę statystyczną, wizualizację oraz interpretację biologiczną, Olink Analyze stanowi narzędzie wspierające prowadzenie badań proteomicznych, identyfikację biomarkerów oraz analizę zależności pomiędzy profilem ekspresji białek a procesami biologicznymi i stanami chorobowymi.

Olink NPX Software – oprogramowanie do przetwarzania, normalizacji i kontroli jakości danych proteomicznych

Olink NPX Software to oprogramowanie umożliwiające konwersję surowych danych pomiarowych do znormalizowanych wartości NPX (Normalized Protein eXpression), które stanowią standardowy format wyników wykorzystywany w analizie ekspresji białek. Oprogramowanie zapewnia zautomatyzowany i wystandaryzowany proces przetwarzania danych, obejmujący normalizację, kontrolę jakości oraz przygotowanie wyników do dalszych analiz bioinformatycznych. W zależności od wykorzystywanej platformy Olink dostępne są dwa główne moduły oprogramowania: • NPX Map – przeznaczony do przetwarzania danych z platform opartych na sekwencjonowaniu nowej generacji (NGS), takich jak Olink Explore HT oraz Olink Reveal. • NPX Signature – przeznaczony do analizy danych uzyskiwanych z platform qPCR, takich jak Olink Target 96, Olink Target 48, Olink Flex. Kluczowym elementem działania Olink NPX Software jest zautomatyzowana kontrola jakości (Quality Control, QC). Oprogramowanie monitoruje poprawność przebiegu analizy na podstawie kontroli wewnętrznych. Oprogramowanie umożliwia eksport danych bezpośrednio do Olink Analyze lub do platformy Olink Insight w celu przeprowadzenia zaawansowanych analiz statystycznych, wizualizacji oraz interpretacji biologicznej wyników. Olink NPX Software zapewnia spójny, zwalidowany i skalowalny proces przetwarzania danych proteomicznych, umożliwiając uzyskanie wiarygodnych wyników badań biomarkerów oraz ich dalszą analizę w badaniach podstawowych, translacyjnych i klinicznych.

Olink Shield – oprogramowanie wspierające integralność danych i zgodność z wymaganiami 21 CFR Part 11

Olink Shield to moduł oprogramowania, którego zadaniem jest zapewnienie integralności danych, identyfikowalności działań użytkowników oraz zgodności z wymaganiami regulacyjnymi, w szczególności z przepisami 21 CFR Part 11 dotyczącymi elektronicznych zapisów i podpisów elektronicznych. Rozwiązanie zostało zaprojektowane jako rozszerzenie dla oprogramowania Olink Signature Q100 oraz NPX Signature, wspierając laboratoria prowadzące badania regulowane i kliniczne.